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TU Dresden
Dept. for Innovative
Methods of Computing
 

Theses

Dissertations
  • Ostrenko, Oleksandr: Quantitative Modeling of Bile Secretion and Transport in the Liver, Technische Universität Dresden, 2018

  • Rost, Fabian: Data-driven Modeling of Cell Behavior, Morphogenesis and Growth in Regeneration and Development, Technische Universität Dresden, 2017

  • de Back, Walter: Multicellular Systems Biology of Development, Technische Universität Dresden, 2015

  • Mente, Carsten: Tracking of individual cell trajectories in LGCA models of migrating cell populations, Technische Universität Dresden, 2015

  • Hatzikirou, Haralambos: Lattice-gas cellular automata models for the analysis of cancer invasion, Technische Universität Dresden, 2009

  • Klauss, Tobias: An interacting particle system for collective migration, Technische Universität Dresden, 2008

  • Peruani, Fernando: From individual to collective motion of self-propelled particles: the role of particle shape, orientational ordering and clustering, Technische Universität Berlin, 2008

  • Moreira, Joana: Mathematical modelling of interacting cell populations: germinal centre dynamics and spatio-temporal pattern formation in the zebrafish, Danio rerio, University of Lisbon, 2006

  • Börner, Uwe: Modelling myxobacterial rippling: pattern formation in a multicellular system, Technische Universität Dresden, 2004

  • Walther, Thomas: Mathematical and experimental investigation of yeast colony development -- a model system for the growth of filamentous fungi in heterogeneous environments, Technische Universität Dresden, 2004

  • Dormann, Sabine: Pattern formation in cellular automaton models, Universität Osnabrück, 2000

Master and Bachelor theses
  • Syga, Simon: Collective cancer cell invasion: mathematical modeling and analysis, Master, Technische Universität Dresden, 2018

  • Nigmetzianov, Renat: Modelling scaling behavior of cytoskeletal patterns, Master, Technische Universität Dresden, 2017

  • Batagiannis, George: Extended Mean-field Descriptions for Cellular Automaton Models of Collective Cell Behaviour, Master, Technische Universität Dresden, 2017

  • Lacher, Lea: Modeling and Simulation of Pattern Formation during Multiple-Head Regeneration in Planarians, Master, Technische Universität Dresden, 2016

  • Reher, David: Adhesion heterogeneity in cell populations affects invasive behaviour, Master, Technische Universität Dresden, 2016

  • Hoffmann, Karl: An Interacting Particle System Model of Planar Cell Polarity Re-Organization, Master, Technische Universität Dresden, 2015

  • Lacher, Lea: Mathematical Modelling and Bifurcation Analysis of Somitogenesis, Bachelor, Technische Universität Dresden, 2014

  • Garbe, Martin: Systematic analysis of differences in cellular signaling pathways across different grades of gliomas, Master, University of Applied Sciences Mittweida, 2014

  • Wobus, Lars: Entwicklung und Performanceanalyse eines Bildauswertungsalgorithmus für Filmsequenzen hochaufgelöster biologischer Fluoreszenzmikroskopiedaten, Bachelor, Technische Universität Dresden, 2012

Diploma theses
  • Asmus, Josefine: Modelling transcytosis in hepatocytes, Ernst-Moritz-Arndt-Universität Greifswald, 2012

  • Zimm, Roland: A systems biological approach to pancreatic gene regulation, Technische Universität Dresden, 2011

  • Korn, Arnd: Modellierung embryonaler Strukturbildung: Molekulare Regulationsmechanismen der Somitogenese in Wirbeltieren, Technische Universität Dresden, 2010

  • Sander, Martin: Agentenbasierte Modellierung des intrazellulären Vesikeltransportes, Technische Universität Dresden, 2010

  • Rost, Fabian: Modellierung und Analyse der embryonalen Strukturbildung in Fischmuskeln, Technische Universität Dresden, 2010

  • Mente, Carsten: Model-based prediction of early angiogenic pattern formation, Technische Universität Dresden, 2008

  • Peter, Joachim: Entwurf und Implementierung einer Toolbox zur Analyse von Simulationen zellulärer Gittergasautomaten, Technische Universität Dresden, 2008

  • Tektonidis, Marco: Parameter optimization in a cellular automaton model of cancer growth based on medical MRI data, Technische Universität Berlin, 2008

  • Babiel, Thomas: Mathematische Modellierung proximodistaler Musterbildung am Beispiel des Axolotls, Technische Universität Dresden, 2007

  • Lukacs, Monique: Mathematical characterization of morphogenetic interaction in early zebrafish development, Technische Universität Dresden, 2004

  • Starruss, Jörn: Mathematische Modellierung der Selbstorganisation von Myxobakterien, Technische Universität Dresden, 2004

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